1、提高产量。实践证明，微生物菌剂特定的肥料效应不仅为农作物提供营养元素，其有效菌还能分泌赤mei素、细胞分裂素、生长素等活性物质，刺激、调节、促进作物的生长发育，有利于农作物增产。
2、改善品质。微生物菌剂能有效地改善农产品品质。实践证明，施用微生物肥料收获的农产品，蛋白质、糖分、维生素、氨基酸等有益成份含量明显提高，农用生物菌剂的作用，籽粒、果实丰满光滑，蔬菜果品色泽亮丽，
既好吃又好看，价值还高。有的微生物肥料产品，还可以减少xiao酸盐的积累，提高农产品的安全性。
3、增强作物的抗逆性能。大多微生物菌剂中的有效菌，具有分泌抗素类物质和多种活性酶的功能，能抑制或杀致病菌，降低病害发生及增强作物的抗逆性，如可增强农作物的抗旱、耐寒、抗倒伏、防病及抗盐碱能力，太原生物菌剂的作用，同时还能有效预防作物生理病害的发生。
4、提高化肥利用率。微生物菌剂有效菌大多能分解土壤中有机质，有机质分解过程中生成腐殖酸，腐殖酸与土壤中的氮形成腐殖酸铵，可减少氮肥的流失。解钾溶磷有效菌能将土壤中固化的化学钾肥、化学磷肥分解转化为效钾、效磷，提高其利用率，降低生产投入，减少资源浪费。
5、改善土壤养分。微生物菌剂有效菌能够促进土壤中难溶性养分的溶解和释放，提高土壤养分的供应能力。有效菌所分泌胞外多糖物质，是土壤团粒结构的粘合剂，能够增强土壤团粒结构，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有机质，活化土壤中的潜在养分，改善土壤中养分的供应状况。
使用生物菌肥必须投入充足有机肥
有机质是微生物的主要能源，护根铁甲生物菌剂的作用，有机质分解还能供应微生物养分。因此，施用生物肥料时必须配合施用有机肥料，所以菜农在使用菌肥时应与粪肥等有机肥一起施用，不但可加快有机肥的腐熟速度，而且能促进菌群的形成，提供菌肥的肥效。因此，必须供应充足的氮磷钾及微量元素。例如豆科作物生长的早期，必须供应适量的氮素，以促进作物生长和根瘤的发育，全营养生物菌剂的作用，提高固氮量；施磷肥能发挥“以磷增氮”的作用；适量的钾钙营养有利于微生物的大量繁殖；钼是根瘤菌合成固氮酶必不可少的元素，钼肥与根瘤菌肥配合施用，可明显提高固氮效率。
生物菌不宜与氮磷钾大量元素肥料共同使用
生物菌适合与有机质共同使用，但是与氮磷钾等复合肥料共用，能杀部分微生物菌，降低肥效。
有机肥是大量有机物质经过堆积或添加微生物发酵剂发酵而成，多数为禽畜粪尿、植物秸秆、各种有机废弃物，经过堆积发酵或者添加微生物菌剂发酵而成，如果未经过处理的有机肥料直接使用在农田里容易形成二次发酵造成烧跟烧苗的问题。
使用金宝贝肥料发酵剂发酵好的有机肥对土壤有什么好处
1、有机肥可以提供作物生产所需要的养分，可以为作物成长提供充足的养分供给作物生长(除矿物质养分)，有机质在土壤中分解产生二氧化碳，可作为作物光合作用的原料，有利于作物产量提高。
2、改良土壤结构，增强土壤肥力，提高土壤有机质含量，更新土壤腐殖质组成，培肥土壤 ，土壤有机质是土壤肥力的重要指标，是形成良好土壤环境的物质基础。土壤有机质由土壤中未分解的、半分解的有机物质残体和腐殖质组成。
新鲜有机肥料，在金宝贝微生物作用下，分解转化成简单的化合物，同时经过生物化学的作用，又重新组合成新的、更为复杂的、比较稳定的土壤特有的大分子高聚有机化合物，为黑色或棕色的有机胶体，即腐殖质。腐殖质是土壤中稳定的有机质，对土壤肥力有重要影响。
3、提高土壤生物活性，刺激作物生长，有机肥料是微生物取得能量和养分的主要来源，施用有机肥料，有利于土壤微生物活动，促进作物生长发育。
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